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医学院是亳州职业技术学院实施特色发展的二级教学单位，现有本科、专科、五年制大专三个培养层次，开设护理、康复治疗技术、针灸推拿和中医学四个专业，在校学生3865人。建筑面积约5800平方米的实训楼，内设解剖、病理、生理、基础护理、内外妇儿、康复、针灸推拿、中医临床技能等26间实训室，仪器设备总价值1080余万元。
医学院现有专职教师57人，其中国家二级教授2人，享受国务院特殊津贴1人，省、市学术和技术带头人2人，高级职称教师10人，中高级“双师”11人，双师型教师 36人，省级教坛新秀3人，省级技术能手1人，有硕士学位的占85%。聘任国家名中医、省级名医、江淮名医及高级职称医师等52人为兼职教授。
医学院现有国家级精品课程1门、省级精品课程及大规模在线开放课程(MOOC)11门、校级金课3门，省级特色专业教学资源库2项，省级示范专业1个，省、市级教科研项目40余项，参与国家自然科学基金项目1项，省级教学团队2个;医学院现有华佗中医院、蒙城县中医院、利辛县中医院等非直属附属医院3家，与中国科学技术大学附属医院(省立医院)、安徽医科大学一附院、安徽省中医院、江苏大学附属医院等32家省内外医院签订实习合作协议。与安徽省中医院、亳州市中医院和太和县中医院等联合开展“中医师承”教育。
五年来，获安徽省高等职业院校教学能力大赛一等奖3次、二等奖2次，获“安徽省红十字生命教育微课程活动”一等奖;获省级技能大赛一等奖3项、二等奖2项;获世界技能大赛“健康与社会照护”比赛一等奖1项、二等奖2项。王秀蓉老师获“全国红十字之星”荣誉称号，闫岩获“安徽省技术能手”荣誉称号;2020年获中华职业教育创新创业大赛国赛一等奖，2022年获第十三届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛国赛铜奖，2022年获安徽省教学成果二等奖。2019年医学院健康志愿者协会被共青团安徽省委员会授予“青年志愿者优秀组织”荣誉称号，2020年医学院获首批“全国红十字模范单位”荣誉称号，2023年医学院获“全国巾帼文明岗”荣誉称号。
医学院坚持落实立德树人根本任务，秉承“德技双馨，止于至善”的职业精神，以培养优秀医护人才为己任，为高水平大学和世界中医药之都建设作出应有的贡献。
校内专任教师：57人
校外兼职教师：52人
教授、副教授：10人
国务院、省政府津贴专家：1人
主院校地址：安徽省亳州市安徽省亳州市药都路1625号
