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中药系目前开设中药学专业、中医养生保健专业。中药学专业创办于1979年，为省级精品专业、国家教育部、财政部、省教育厅“以奖代补”项目重点支持建设专业、教育部高等职业教育创新发展行动计划(2015-2018年)重点专业、首批全国职业院校健康服务类示范专业点，历时40余年积淀，为我省医药行业输出了2万多名中药技术技能人才，因教学质量优良、毕业生实践能力强等办学特色，深受社会好评。
中药系同厦门片仔癀宏仁医药有限公司、厦门中药厂有限公司、厦门文灶药店连锁有限公司、厦门九鼎药房有限公司、福建新紫金医药有限公司、福建好安心大药房有限公司、福建海王福药制药有限公司、省立医院、省二人民医院等60多家企事业单位共建了校企合作实训基地，为学生的专业实训、就业创业提供了良好条件。开设有订单班、二元制班、退伍军人班。开展“中药调剂员”、“医药商品购销员” “健康管理师”“现场救护员”和“药物检验工”等技能培训，双证书获取率近100%。中药系学生每年参加国家级、省级各类技能竞赛多次获得一、二、三等奖，一直以来，毕业生就业率均在98%以上，主要面向省内外医药企事业、各级医院药房，主要从事中药及中成药营销、中药质检、中药种植、中药制剂、中药炮制、中医药养生、健康管理等工作。
中药系目前有专任教师28人，具有硕士研究生以上学历19人，高级职称9人，中级17人，双师型教师12人，长期聘请医药行业企业及各级医院等富有经验的专家担任客座教授、兼职教师40余人，设有中药教研室、中医教研室和中医药实验实训中心，组建福建中草药研究所和福建中医药文化传承中心、中药技术团队、中医药养生团队，承担着相关专业课程的教学、实习和实训工作，同时为推进健康中国建设，提高人民健康水平，开发多种提高人民健康水平的中药健康适宜技术。系部教师近几年开展的国家级、省级、局厅级、院级课题30余项。教师主编、副主编、参编全国高职药学类规划教材、校企合作教材20余部。
校内专任教师：28人
校外兼职教师：40人
专教硕士以上学位：19人
主院校地址：福建省福州市洪山桥中店42号
大学城校区地址：福州市大学城侯官路149号
