医药卫生系(市卫生学校)由原医药卫生系和中专部(市卫生学校)合署办公后成立。医药卫生系(市卫生学校)秉承学院“明德修身，格物致知”的校训，认真贯彻落实国家健康、养老相关政策，立足自治区经济发展，依托生物医药重大产业链，科学布局专业，深化产教融合，加强校企合作，稳步提升办学条件和人才培养水平。

医药卫生系(市卫生学校)现分为高职部和中职部。高职部现开设药品生物技术专业(含中草药种植与加工技术方向)、食品生物技术专业、护理专业、康复治疗技术专业、健康管理专业5个专业6个方向。其中，药品生物技术专业为国家级优质校重点建设专业，自治区骨干建设专业;药品生物技术高水平专业群为在建自治区高水平专业群。从2019年开始，每年招生数量稳定在450人，目前在校生人数1402人。中职部现开设护理专业和中医专业2个专业。2018年申报成功“自治区中等职业教育改革发展示范中专部建设项目”和“自治区现代中等职业教育质量提升工程骨干特色创新型专业建设项目”。每年招生数量稳定在240人，目前在校生人数816人。

医药卫生系(市卫生学校)拥有一支师德高尚、专兼结合、结构合理的“双师型”教师队伍。现有教职工148人，其中专任教师110人，行政管理人员32人，医护人员6人;专任教师中具有高级职称24人(教授6名，副教授18名，主任医师1，高级讲师21人);博士11人，硕士29人，双师型教师占90%以上。拥有自治区创新教师团队1个，荣获自治区黄炎培杰出教师1名，荣获自治区青年创新人才奖1名，自治区新世纪“321”人才二层次1名，三层次2名。自治区专业带头人1名，校级专业群带头人1名、专业带头人5名，校级教学名师2名，教坛新秀1名。近年来，专业教师主持省级以上科研项目20余项，发表高质量学术论文20余篇，申请国家发明专利10项，编写教材12部。

医药卫生系(市卫生学校)拥有先进的实训条件，能满足各专业的实训要求。现有基础护理实训室、康复治疗实训室、数字人虚拟仿真实训室、生物制品生产线、发酵工程生产线及药品食品检验检测设备，总工位450，总面积5000平方米。总投资1750万元，总面积6000平方米的科研创新平台已投入使用。为进一步开展校企合作，深化产教融合，先后与内蒙古人民医院、呼和浩特市第一医院、惠丰堂、国大药房、华测集团等建立了良好的合作关系，为学生顶岗实习和就业奠定了基础。

医药卫生系(市卫生学校)积极探索“双元”育人机制，立足产业发展需求，面向岗位能力要求，开发产教融合课程体系，实现专业对接产业需求，课程内容对接岗位标准，教学过程对接生产过程，较好地实现了人才培养目标。目前有自治区级精品课1门，院级优质资源课7门，精品在线开放课2门，金课13门。学生在各级各类技能竞赛、“互联网+”大学生创新创业大赛、“挑战杯”大学生课外学术科技作品竞赛中，获国家级金奖1项，银奖三项，铜奖2项，自治区级一等奖5项，二等奖10项。

学院卫生所、化学生物研究所、呼和浩特马铃薯食用菌研究院、生物标本馆也设在医药卫生系。生物标本馆集教学、科研、科普宣传和社会服务为一体多功能标本馆。自2018年正式开放以来，每年吸引众多自然科学爱好者前来参观学习，并承担学院参观接待、新生入学教育等任务，先后被内蒙古自治区科学技术协会、内蒙古自治区科学技术厅评为“自治区科普教育基地”和“自治区生物铸型标本科普示范基地”。马铃薯研究院的研究成果“紫薯花青素提取工艺技术研究与产业化开发”获首届内蒙古自治区科技工作者创新创业大赛银奖。

医药卫生系(市卫生学校)在办学实践中，积累了丰富的办学和管理经验，未来将继续坚持以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，紧紧围绕学院“十四五”发展规划，不断提升综合实力和办学水平，在学院“提质培优”“双高建设”“职业本科”建设中做出应有的贡献。