药学与检验系设有四个专业：药学专业、药品经营与管理专业、药品生产技术专业、医学检验专业。

药学专业设立于2002年，首次招生2003年，是学校骨干专业及特色专业， 2019年6月，教育部职业教育与成人教育司网站公布了关于《高等职业教育创新发展行动计划(2015-2018年)》项目认定名单，药学专业被认定为国家级骨干专业。该专业专升本率连续几年在65%以上，就业率90%以上，其教学团队为山东省省级教学团队。

药学专业近几年来，就业市场非常好，就业环境及就业质量也大幅度提升，根据学生学习层次不同，专科层次就业主要分布于药品生产、经营企业，也有少部分在医疗机构岗位就业，本科层次就业除以上就业领域外，可通过考试进入药品监管部门工作。

药品经营与管理专业前身是医药营销专业，于2007首次招生，因2016年教育部专业目录调整，医药营销专业更名为药品经营与管理专业。在“健康中国”的理念下，高素质的药品经营与管理的人才需求量大大增加，该专业毕业生好就业、薪资高、晋升空间大。

该专业毕业后在医疗卫生系统、制药企业、医药贸易公司等相关领域，从事药品零售服务(营业员、药师、店长)，从事医院药房和社会药房药学服务、药房管理等工作，从事市场开发(医药代表、区域经理)以及药品质量管理、药品仓储、电子商务和物流管理等相关工作。

药品生产技术专业设立于2018年，首次招生2019年，该专业与药学、药品经营与管理专业共享软硬件资源。该专业毕业后主要面向药品生产企业从事药品生产、质检等岗位工作。

医学检验专业设立于2007年，首次招生2008年，为我校特色专业及骨干专业，现为全国高等院校医学检验技术专业校际联合会理事单位。2019年6月，教育部职业教育与成人教育司网站公布了关于《高等职业教育创新发展行动计划(2015-2018年)》项目认定名单，医学检验专业被认定为国家级骨干专业。2018年该专业教学团队被评为山东省省级教学团队。

药学与检验系下设有药学教研室、药品生产技术教研室、药品经营与管理教研室、药理教研室、化学教研室、检验教研室、微生物教研室7个教研室，设有药学实验实训中心、医学检验实验实训中心2个实训中心、1个学生工作办公室。现有教师42人，其中教授5人，副教授10人，高级职称占比36%，硕士以上学位占70%。山东省优秀共产党员3人，菏泽市岗位明星1人，菏泽市拔尖技术人才1人，菏泽市先进基层党组织1个。共有10门省级精品课程，3门省级精品资源共享课。

近几年来，学校加大专业建设投资力度，促进专业建设。目前药学实验实训中心拥有药学基础实验实训中心、模拟GMP制药工艺流程车间、模拟静脉用药集中调配中心、药学虚拟仿真实训中心，实验设施及仪器设备软硬件资产总额约800余万。医学检验实训中心面积达1560平米，配备有全自动生化分析仪、全自动五分类血细胞分析仪、全自动血凝分析仪等价值400余万元仪器设备及常用教学标本。2015年投资100余万元建设了现代化的仿真检验科,让学生在仿真的环境中实训，培养学生规范操作和生物安全保护意识，同时作为社区医院检验技术人员专业培训与技术考核的场地。为进一步加强学生实习实训，学校长期稳定合作的校外实习基地共有15家，实习效果反馈较好，实习单位对我校药学专业实习生高度满意。