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生物工程学院是焦作工贸学院重点建设学院之一，是一个多学科渗透，具有理工融合特点的学院。目前开设药品生物技术、食品生物技术、中药材生产与加工、中草药栽培与加工技术、药品经营与管理、体育保健与康复等六个专业。
学院注重师资队伍建设，坚持引进和培养并举，现已拥有一支师德师风好、科研能力强、教学水平和业务素质高的师资队伍。教师队伍中硕士学位以上教师占70%。学院拥有良好的教学条件，实验教学中心设有有机化学实验室、无机化学实验室、微生物实验室等，配有高效液相色谱仪、红外光谱仪、紫外分光光度计等大型精密仪器及先进齐全的基础实验室设备，为学生提供了优越的学习环境和丰富的学习资源。
生物工程学院终坚持以提高人才培养质量为核心，积极推进人才培养模式改革，全面提高学生的专业能力、方法能力和社会能力。就业单位主要有生物医疗器械企业、生物制药企业、食品生物企业、生物环保企业、生物农业企业、中药材种植企业、中药饮片生产企业、中药原料药生产加工企业、中药科研单位、中药材市场管理部门、企事业单位实验室、医院检验部门等单位，从事生物发酵控制、产品分离纯化、环境生物检测、生物制品研发及工艺设计辅助、生产组织与管理，可应职于中药材生产、技术、管理、加工、销售、服务等职业岗位群，食品药品市场营销等工作。
专教硕士以上学位占比：70%
主院校地址：河南省焦作市中原路南段1216号
沁阳校区地址：沁阳香港街1号
