医学技术系是我院成立最早的教学单位之一，现开设有医学检验技术、康复治疗技术、医学美容技术、食品检验检测技术、中医养生与保健及化妆品经营与管理六个专业。其中康复治疗技术专业为省级特色高水平专业;医学美容技术专业和化妆品经营与管理专业为中国特色现代学徒制试点专业;医学检验技术专业为院级特色专业;医学美容技术专业与无锡呈美企业管理有限公司校企合作，开展订单式培养。

医学技术系现有校内教师56人，兼职教师38人;副教授及以上高级职称31人，讲师及中级职称47人，硕士32人;省级教学名师1名，院级教学名师3人;省级教坛新秀3人，院级教坛新星3人;省级金牌职工2人;皖西最美教师1人。全体教师积极开展教育教学改革，认真开展教科研活动。自“十三五”至今，系部教职工承担省级科研项目15项，其中重大项目1项，重点项目9项;承担质量工程建设项目50余项，其中省级质量工程一般建设项目23项，重点建设项目2项;省级教学成果奖一等奖1项，二等奖2项;省级教学业务竞赛一等奖1项，二等奖2项，三等奖3项;荣获安徽省职业院校教师教学能力大赛一等奖2项、二等奖4项、三等奖4项;全国职业院校教学能力大赛二等奖2项。发表论文百余篇，其中一类论文和二类论文各1篇，三类论文31篇;参编教材50余部，其中主编10余人次，副主编20余人次;国家专利5项。

医学技术系注重实践技能培养，以理实一体化教学为载体，强化“产教融合、校企合作”，形成以培养高素质技术技能型人才为目标的教学特色。系部积极探索人才培养方式改革，医学美容技术和化妆品经营与管理专业开展中国特色现代学徒制人才培养模式，并取得良好效果。系部现有在校生1500余人，建有三大类共14小类实验实训室;在省内外建有33个校外实习基地。系部创建校内大学生创业孵化基地1个;承担教育部1+X 《运动营养咨询与指导》职业等级证书培训任务，建有实训基地1个，并获得2022年度优秀试点院校称号。近两年系部学生获得安徽省“互联网+”创新创业大赛金奖2项，银奖4项，铜奖4项，获中国国际“互联网+”大学生创新创业大赛铜奖2项，获得第十六届安徽省大学生职业规划设计大赛金奖1项。系部一直倡导“以赛促学、以赛促教、以赛促练”的教学理念，积极组织学生参加各级各类技能竞赛。2016年与2019年，康复治疗技术专业学生荣获安徽省高职高专技能大赛康复组团体第一名和第二名的好成绩;医学检验技术专业学生荣获2021安徽省大学生基础医学实验技能竞赛二等奖和2022安徽省大学生基础医学实验技能竞赛一等奖;2022年医学检验技术专业学生荣获第八届全国大学生基础医学创新研究暨实验设计论坛大赛三等奖;医学美容技术专业学生获得2022-2023年度安徽省职业院校技能大赛高职组三等奖。各专业历年毕业生就业率都在96%以上，且就业质量逐年提高。