医学院是岳阳职业技术学院的二级学院，其临床医学专业历经了60余年的发展与沉淀，俨然成为了岳阳职业技术学院的一张名片。现开设有临床医学、药学、助产、医学检验技术、预防医学、婴幼儿托育服务与管理6个专业，其中临床医学专业、预防医学为学院仅有2个国家控制专业;助产专业为全国职业院校健康服务类示范专业点;药学和助产专业为湖南省特色专业。医学院是全国高等职业学校骨干教师药学专业企业顶岗培训基地、湖南省助产人员岗位规范化培训基地、湖南省乡村医生本土化培养基地、国家职业资格健康管理师与生殖健康管理师等职业培训与鉴定点。

医学院学生来自全国14个省市，现有全日制在校学生4600余人。教职员工90余人，师资队伍结构合理，业务精湛。其中教授、主任医师等10人，副教授、副主任医师等25人;博士3人，硕士40人;双师素质教师占全体教师人数的92%;湖南省青年骨干教师8人。为了更好加强专业建设，医学院从北京大学护理学院、中南大学、厦门医学院、湖南省妇幼保健院聘请了客座教授5人。医学院师生近三年来参加全国各类竞赛屡获佳绩，其中获教育部信息化教学竞赛二等奖1项;全国职业院校技能大赛教学能力比赛二等奖1项;湖南省教师职业能力竞赛一等奖1项、二等奖1项、三等奖2项;获第四届全国微课大赛一等奖1项、二等奖一项;临床医学专业学生获全国临床技能大赛一等奖3项、二等奖2项、三等奖3项;医学检验技术专业学生在全国检验技能竞赛获得2项一等奖、4项三等奖。获首届湖南省医学技能创新创业大赛一等奖。医学院牵头主持建设的助产专业教学资源库2019年立项为国家级教学资源库。医学院学生党支部被立项为“全国党建工作样板支部”;医学院党总支被立项为湖南省高校党建“标杆院系”;医学院被立项为湖南省“三全育人”综合改革试点院(系)。先后获得湖南省“暑期三下乡社会实践优秀团队”、湖南省“基层卫生本土化人才培养先进单位”、“湖南省教育系统先进基层党组织”、助产专业教学团队“岳阳市芙蓉标兵岗(学术型)、湖南省五四红旗团总支等荣誉称号。近三年来，药学专业教师团队有5人在制药企业兼职，为企业创造经济效益约800万元，引进横向合作科研经费近100万元。

近三年来先后有20余名专业老师境外访学交流，承担湖南省自科基金课题3项，湖南省教育厅课题、湖南省教育规划课题、湖南省社科课题等15项、各类市级课题20项、院级课题24项;在国内外学术刊物发表科研论文150余篇，其中，国际SCI收录期刊发表论文6篇。

医学院设有教务科、学生科、团总支、实习就业科、综合科5个科室和1个岳阳市慢性病防治重点实验室、1个药物研究所、1个中草药添加剂应用技术研究中心、1个医疗过错鉴定中心;设有内科、外科、妇产、儿传、预防、药理、药学、中医中药、医学检验和微免等9个教研室。

医学院与湖南科伦制药有限公司岳阳分公司、华厦眼科集团等多家知名企业实行了“订单培养”;现有中南大学湘雅医院、南方医科大学附属南海医院、湖南省儿童医院、岳阳市一人民医院、岳阳市二人民医院、临湘市人民医院、平江县人民医院等省内外各级实习就业基地59家;各专业均可实施“专升本”，学生通过深造可获得全日制统招本科毕业证和学士学位证;近年来毕业生的就业率达到90%以上，毕业生就业满意度高于74%，均高于全国高职院校平均水平。