林学系是学院办学历史最长、师资力量最雄厚的优势特色系，本系传承学院近70年的林业职业教育办学经验，以服务发展为宗旨，以促进就业为导向，实施以培养技术技能人才为主体、以科技开发和成教培训为两翼的“一体两翼”办学模式，拥有学院最优势的品牌专业，在林业行业中享有很高的声誉。

现设有林业技术、林业信息技术应用、森林和草原资源保护、森林生态旅游与康养、旅游管理、食品检验与检测、食品药品监督管理等专业，其中林业技术专业被国家教育部、财政部列为中央财政支持的国家级重点建设专业;林业技术、森林资源保护、食品营养与检测为福建省省级精品专业，现已形成以林业、森林旅游、绿色食品检测为优势和特色，服务福建省生态文明示范区建设的林业行业特色高职教育办学格局。

林学系师资力量雄厚，拥有1个国家级优秀教学团队、2个省级优秀教学团队。在47名专任教师队伍中，教授10名、副教授及高级工程师以上的19名，高级职称占40.4%，博士4名、硕士35名，高学历教师占83%，双师型教师占89.3%;高职称、高学历、双师型教师比例位居全省高职院校前列。近3年来，有38位教师主持和参与完成的国家、省部、地厅级科研项目32项，历年来荣获国家教学成果奖一等奖1项，二等奖1项;省级教学成果奖特等奖2项，一等奖2项;省科技进步一等奖1项、二等奖3项、三等奖4项，市级科技进步奖7项，实用新型专利3项，6项科技成果与32家企业对接，主编或参编的各类著作9本、国家与省级统编教材35本;发现植物新种6种，发现福建植物分布的新记录种15个。

林学系实训条件优越，建有2个国家教学实训基地、2个省级教学实训基地;1个智慧林业产业学院;1个省级森林生态科普教育基地。现建成林业综合实训基地、森林食品检验检测中心、森林碳汇计量与监测研究室、森林资源“天地空”一体化监测实训室、游管理综合实训基地等30多个实训室和生产性实训基地;具备法定资质的林业调查设计院、森林资源资产评估事务所、林业有害生物省级疫情鉴定中心3个技术服务机构，形成集“实习实训、职业培训、技能鉴定、技术研发及生产服务”等功能五位一体，与林业生产真实环境一致的校内生产性实训基地。同时与武夷山国家公园、福建省洋口国有林场、福建省林业勘察设计院等35个大型企事业单位建立紧密型的校外生产性实训基地，为培养技术技能型人才提供了良好的实训条件和保障。

近年来，学院教师深入到全省各地推广油茶嫁接技术、毛竹林生态培育技术等林业实用新技术90项，直接受益人口近20万人，产生了良好的经济、生态和社会效益;开发“福建省古树名木信息管理系统”，承担全省古树名木的数据库建立和挂牌保护、林木种质资源调查、森林资源规划调查、森林经营方案编制、林业有害生物调查等林业大型专项调查的技术支撑和业务指导工作。近五年来、组织师生林木种质资源调查、森林资源资产评估、建设项目可行性研究、林业有害生物调查、珍稀植物银粉蔷薇资源分布调查等技术服务70多项。

本系坚持“以就业为导向、以教学为中心、以质量为保证、以能力为根本”办学理念，以工学结合为切入点，实施“三主体 四阶段”智慧林业人才培养模式，注重学生技能培养，所有专业均采用“双证”制的教学模式。毕业生以“综合素质高、专业基本功扎实、职业能力强”的鲜明特色受到用人单位广泛好评，为福建省培养了大批的林业科技人才，就业率高，被誉为“八闽林人的摇篮”。