中医学院始于1968年，是学校特色学院，是“全国乡村医生中医学历教育项目基地”、“中医类别国家医师资格实践技能考试基地”、“全国中医药文化宣传教育基地”、“重庆市乡镇卫生院中医临床技术骨干培训基地”、 “重庆三峡国际中医药培训中心”。

学院开设了中医学、中医骨伤、针灸推拿、康复治疗技术、医学美容技术、中医养生保健、言语听觉康复技术7个专业，现有在校生4000人。中医学、针灸推拿、中医骨伤专业为医学类专业，毕业后均可报考中医执业助理医师。

学院专业特色突出。学院围绕大健康产业的医、美、康、养，打造中医特色的医学、美容、康复、养生4个专业群。中医学专业为教育部创新发展行动计划认定的国家级骨干专业、教育部“双高计划”建设专业群建设专业，重庆市优质校示范专业、骨干专业。针灸推拿专业为重庆市专业能力提升项目、重庆市优质校项目重点建设专业。中医骨伤专业是重庆市优质校项目重点建设专业。康复治疗技术专业为重庆市骨干专业、教育部“1+X”证书试点专业，建有国家级生产性实训基地，与加拿大罗耶斯特学院开展国际合作办学。医学美容技术、中医养生保健专业为新兴的特色专业，毕业生供不应求。

学院办学实力雄厚。有中医类教师200余名，其中教授、副教授50余名;博士、硕士65名;多人次荣获重庆市学术技术带头人、重庆市最美教师、重庆市教书育人楷模、重庆市骨干教师、重庆市优秀教育工作者、重庆市优秀思政工作者、重庆市名中医，学校师德标兵等称号。近年来，教师编写国家、行业规划教材81部;出版专著10余部;在核心期刊发表论文100余篇;承担科研课题71项，其中国家社科基金项目1项，国家中医药管理局项目2项，省部级课题20余项。

学院深化校院合作，校内建有集教学、培训、技能鉴定、应用技术研究等功能为一体的专业实训基地，实训室面积5000余平方米，教学仪器设备值1000万元。建有校外实习、教学医院80余家、企业20余家。

学院办学质量社会认可。为地方培养了深受行业欢迎的中医类人才27000余名。学院以学生为本，狠抓教学质量，近年来毕业生就业率保持在98%以上。首届“慧医谷杯”中医临床技能大赛、全国康复治疗技术专业学生技能大赛、全国职业院校针推技能大赛、全国高等院校医疗美容技能竞赛、全国大挑战杯、重庆市小挑战杯、创新创业等竞赛中多次获得团体一等奖、二等奖、三等奖和个人奖项;中医学院团总支先后获得团中央全国高校“活力团支部”，暑期“三下乡”优秀团队等荣誉称号。1名学生荣获“全国优秀共青团员”称号。2020年，学院医学类专业毕业生参加全国中医执业助理医师资格考试，在全国高职院校综合通过率排名第1名。