1997年,云南省地质矿产局职工大学与云南省地矿局技工学校合并。
2001年4月,在云南省地质矿产局技工学校和云南省地质矿产局职工大学基础上合并改制为云南国土资源职业学院。
2002年3月,昆明市宝石职业中学并入云南国土资源职业学院。
2009年1月,云南国土资源职业学院被列为省级示范性高等职业院校。
2013年,云南国土资源职业学院整体搬迁,入驻阳宗海校区。
2015年,学校被教育部列为首批现代学徒制试点单位。
2018年10月11日,学校行政主管部门由原来的云南省地质矿产勘查开发局变更为云南省教育厅